Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms