Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC137Q6PK04 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC137Q6PK04 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms