Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms