Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1QL3Q5VWW1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms