Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH4AQ5TD94 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH4AQ5TD94 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms