Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDK2Q58EX2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms