Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBK1Q52WX2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms