Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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