Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYPL1Q16563 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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