Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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