Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNA2Q15822 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms