Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITSN1Q15811 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
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