Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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