Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDCD1Q15116 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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