Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CSHL1Q14406 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms