Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PEX6Q13608 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms