Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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