Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms