Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP7AQ04656 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms