Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms