Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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