Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms