Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLTPP55058 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLTPP55058 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLTPP55058 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLTPP55058 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLTPP55058 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLTPP55058 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLTPP55058 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLTPP55058 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLTPP55058 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLTPP55058 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLTPP55058 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms