Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGDP52209 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGDP52209 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGDP52209 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGDP52209 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGDP52209 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGDP52209 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGDP52209 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGDP52209 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGDP52209 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGDP52209 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms