Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK8P49336 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK8P49336 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK8P49336 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK8P49336 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms