Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCAMP43121 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCAMP43121 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCAMP43121 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCAMP43121 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCAMP43121 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCAMP43121 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCAMP43121 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCAMP43121 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms