Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL1P40616 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL1P40616 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL1P40616 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL1P40616 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL1P40616 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL1P40616 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL1P40616 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL1P40616 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL1P40616 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms