Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC1P35052 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC1P35052 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC1P35052 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms