Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP1P29466 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP1P29466 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP1P29466 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP1P29466 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP1P29466 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP1P29466 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP1P29466 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms