Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID4AP29374 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms