Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMBRP28336 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMBRP28336 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMBRP28336 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMBRP28336 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMBRP28336 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMBRP28336 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMBRP28336 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMBRP28336 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMBRP28336 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NMBRP28336 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMBRP28336 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMBRP28336 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMBRP28336 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMBRP28336 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMBRP28336 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMBRP28336 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMBRP28336 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMBRP28336 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMBRP28336 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMBRP28336 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMBRP28336 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMBRP28336 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMBRP28336 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NMBRP28336 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMBRP28336 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMBRP28336 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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