Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRBP23467 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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