Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR2F1P10589 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms