Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX58O95786 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX58O95786 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX58O95786 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX58O95786 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX58O95786 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX58O95786 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX58O95786 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms