Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNSO60931 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNSO60931 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNSO60931 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNSO60931 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNSO60931 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms