Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAA1O43292 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms