Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SDR42E2A6NKP2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms