Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms