Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCE3A1L190 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms