Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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SH3BP1Q9Y3L3 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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