Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC092687.2-201ENST00000452909 568 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms