Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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