Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.3 ms