Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SS18Q15532 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SS18Q15532 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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