Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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