Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC008629.1-201ENST00000506486 812 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR5G5P-204ENST00000627642 621 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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