Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms