Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
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CNGB1Q14028 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
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CNGB1Q14028 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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CNGB1Q14028 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
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CNGB1Q14028 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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CNGB1Q14028 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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CNGB1Q14028 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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CNGB1Q14028 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
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