Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms