Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CUL4AQ13619 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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